Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms