Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SFTPCP11686 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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