Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP2AP11388 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms