Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GLI3P10071 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GLI3P10071 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms