Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PKHD1P08F94 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PKHD1P08F94 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PKHD1P08F94 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PKHD1P08F94 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PKHD1P08F94 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PKHD1P08F94 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms