Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GLI1P08151 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GLI1P08151 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms