Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN11O75508 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms