Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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SPAG9O60271 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SPAG9O60271 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SPAG9O60271 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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