Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms