Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms