Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SRRM4A7MD48 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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