Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC78A2IDD5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC78A2IDD5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCDC78A2IDD5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCDC78A2IDD5 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCDC78A2IDD5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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