Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGTPBP1Q9UPW5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms