Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PCDH10Q9P2E7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCDH10Q9P2E7 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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