Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms