Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CENPMQ9NSP4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms