Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms