Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CARD11Q9BXL7 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms