Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms