Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHP1Q99653 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms