Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms