Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms