Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms