Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms