Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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