Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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