Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NRF1Q16656 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms