Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FXNQ16595 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FXNQ16595 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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