Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SSX1Q16384 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SSX1Q16384 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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