Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATP6AP1Q15904 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6AP1Q15904 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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