Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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