Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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PDCD1Q15116 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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