Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD4Q13485 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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