Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXF1Q12946 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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