Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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