Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms