Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms