Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms