Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms