Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms