Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3M2P53677 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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