Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNA1P35221 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms