Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms