Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLD1P28340 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms