Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSFA2P28290 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms