Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB4P28070 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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