Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NFKB1P19838 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms