Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD58P19256 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD58P19256 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD58P19256 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms