Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RARGP13631 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RARGP13631 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RARGP13631 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 879 ms