Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFTRP13569 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFTRP13569 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFTRP13569 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFTRP13569 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFTRP13569 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFTRP13569 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFTRP13569 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFTRP13569 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms